Publications

Publications for year 2025

Publications

• BELEJ, Ľubomír - DEMIANOVÁ, Alžbeta - DANCHENKO, Maksym - MISHRA, Shubhi - BARÁTH, Peter - JURČAGA, Lukáš - LIDIKOVÁ, Judita - BOBKO, Marek - POLÁKOVÁ, Katarína - ŠVECOVÁ, Terézia - BOBKOVÁ, Alica**. Proteomics coupled machine learning—innovative approach in geographical origin authentication of green Coffea arabica. In Food chemistry, 2025, vol. 493, no. 2, p. 145784. (2024: 9.8 - IF, Q1 - JCR, 1.952 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 0308-8146. Dostupné na: https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2025.145784 Typ: ADCA
• BELLOVÁ, Jana - BARÁTH, Peter - DANCHENKO, Maksym - ŠUCHOVÁ, Katarína. Mass Spectrometry-Based Proteomic Profiling of Sugiyamaella. In Thirteenth Annual Conference of the Czech Society for Mass Spectrometry and Eleventh Informal Proteomic Meeting (joint meeting) : book of Abstracts. - Česká společnost pro hmotnostní spektrometrii Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého, 2025, p. 68. ISBN 978-80-907478-5-2. Dostupné na internete: https://www.czechms.org/en/events/cmsc/2025/index.php (13th Conference of Czech Mass Spectrometry together with 11th Informal proteomic meeting (joint meeting).) Typ: AFG
• ČIPÁK, Ľuboš - SIVÁKOVÁ, Barbara - BELLOVÁ, Jana - DANCHENKO, Maksym - JURČÍK, Ján - ČIPÁKOVÁ, Ingrid - KARIKA, Laura-Olívia - GREGAN, Juraj - BARÁTH, Peter. Characterization of Ksg1 protein kinase-dependent phosphoproteome in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. In 49th Annual Conference on Yeasts : Programme & Abstracts. 49. - 2025, p. 67. ISSN 1336-4839. (APVV-20-0141 : Posttranslačná regulácia faktorov zostrihu pre-mRNA. VEGA 2/0059/23 : Charakterizácia nových proteínov podieľajúcich sa na regulácii zostrihu pre-mRNA. ITMS2014+: 313011W428 : Centrum pre biomedicínsky výskum - BIOMEDIRES - II. etapa. VEGA 2/0021/22 : Detailná analýza a objasnenie funkcie Cka1 a Ksg1 proteínkináz využitím ich kondičných na ATP analógy citlivých mutantov.) Typ: AFH
• DANCHENKO, Monika - KALE, Rohan Arjun - DANCHENKO, Maksym - LIBANTOVÁ, Jana. Identification and molecular cloning of a unique protease from carnivorous sundew. In 25th Conference of the Austrian Society of Plant Biology : book of Abstracts, 29th to 31st of May 2025, Tulln an der Donau. - 2025, p. 61. Dostupné na internete: https://boku.ac.at/fileadmin/data/H03000/H83000/H83100/files/ATSPB/ATSPB_2025_BoA.pdf (APVV-23-0448 : Vývin listových pascí mäsožravých rastlín rosičky: Zdroj unikátnych hydroláz s možnosťami využitia v biotechnológiách. Plán obnovy EÚ 09I03-03-V04-00573 : Molekulárne klonovanie a biochemická charakterizácia unikátnej proteázy z mäsožravej rosičky.) Typ: GII
• FLORES - RAMÍREZ, Gabriela - DANCHENKO, Maksym - MILUTOVIC, Goran - ŠKULTÉTY, Ľudovít. Coxiella burnetii survival under doxycycline exposure- an update. In 4th Workshop on biomarkers: advances in infectious and oncological diseases : book of abstracts. - Bratislava : Biomedical Research Center, Slovak Academy of Sciences, 2025, p. 23. ISBN 978-80-972111-8-9. (APVV-19-0519 : Interakcia hostiteľských buniek s Coxiella burnetii: identifikácia a využitie nových terapeutických a diagnostických cieľov. APVV-23-0325 : Eliminácia kliešťami prenášaných infekcií bez použitia antibiotík. 09I03-03-V04-00556 : Regulácia prenostu rickettsia a coxiella prostredníctvom hematofágnych článkonožcov. Workshop on Biomarkers: Advances in Infectious and Oncological Diseases.) Typ: AFH
• HAČKULIČOVÁ, Diana - LABANCOVÁ, Eva - VIVODOVÁ, Zuzana - DANCHENKO, Maksym - HOLEKOVÁ, Kristína - BAJUS, Marko - KUČEROVÁ, Danica, Richterová - BARÁTH, Peter - KOLLÁROVÁ, Karin**. Modification of peroxidase activity and proteome in maize exposed to cadmium in the presence of galactoglucomannan oligosaccharides. In Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, vol. 290, art.no. 117732. (2024: 6.1 - IF, Q1 - JCR, 1.553 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 0147-6513. Dostupné na: https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2025.117732 (VEGA 2/0055/22 : Využitie pôvodných mikroorganizmov a prírodných zlúčenín na zlepšenie klíčenia, rastu rastlín a na zmiernenie abiotického stresu.) Typ: ADCA
• JANKOVIČOVÁ, B. - CHAĽOVÁ, Petra - DVORAKOVÁ, Veronika - ZELINKOVÁ, Eliška - BILKOVÁ, Zuzana - SLOVÁKOVÁ, M. - KORECKÁ, Lucie - MULLER, Petr - DANCHENKO, Maksym - MINICHOVÁ, Lenka - LAKOTA, Ján - ŠKULTÉTY, Ľudovít. Role of human anti-CA I autoantibodies in spontaneous tumor regression and their inhibitory effect on carbonic anhydrase I. In 4th Workshop on biomarkers: advances in infectious and oncological diseases : book of abstracts. - Bratislava : Biomedical Research Center, Slovak Academy of Sciences, 2025, p. 11. ISBN 978-80-972111-8-9. (APVV-18-0340 : Odhalenie molekulárneho mechanizmu spontánnej regresie nádorov s nasledným vývojom nového prognostického nástroja. Workshop on Biomarkers: Advances in Infectious and Oncological Diseases.) Typ: AFH
• KALE, Rohan Arjun - LAKHNEKO, Olha - LIBANTOVÁ, Jana - BARÁTH, Peter - DANCHENKO, Maksym. Proteome profiling of differentially accumulated digestive enzymes from mock-induced trap leaves of Drosera binata. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2025 : zborník recenzovaných príspevkov. Mária Chovancová, Táňa Sebechlebská, Dominik Kostoláni, Dominik Juračka, Dominik Šmida (eds.). 1. vyd. - Bratislava : Univerzita Komenského, 2025, p. 275 - 280. ISBN 978-80-223-6080-7. (APP0553 : Discovery of novel hydrolytic enzymes in carnivorous plants.) Typ: AFD
• KALE, Rohan Arjun - LAKHNEKO, Olha - BARÁTH, Peter - LIBANTOVÁ, Jana - DANCHENKO, Maksym. Proteomic perspective of trap leaf development and prey digestion in carnivorous plant - forked sundew. In Plant Biology Europe 2025. - Budapest, Madarsko : PBE, 2025, p. 7. ISBN 978-615-6833-02-0. Dostupné na internete: https://pbe2025-budapest.org/. (APVV 20 0545 : AQUARAD - Chronické ionizujúce žiarenie narúša odolnosť vodných rastlín voči škodcom: štúdium a validácia biochemických mechanizmov. VEGA 2/0106/22 : Chronické ionizujúce žiarenie ovplyvňuje odolnosť divorastúcich vodných rastlín proti škodcom: Objav a potvrdenie biochemických mechanizmov.) Typ: AFG
• KISHCHENKO, Olena - LAKHNEKO, Olha - ZHOU, Yuzhen - STEPANENKO, Anton - CHEN, Guimin - DANCHENKO, Maksym - BORYSYUK, Mykola. Comparative transcriptome/proteome analyses reveal key pathways responsive to manganese stress in aquatic plant spirodela polyrhiza. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 69 - 70. ISSN 1213-6670. Typ: AFH
• KRYVOKHYZHA, M. - DANCHENKO, Maksym - KLUBICOVÁ, Katarína - KOVÁČ, Andrej - BEKE, Gábor - MATÚŠOVÁ, Radoslava. Proteomic analysis of germinating seeds of parasitic weed— branched broomrape (Phelipanche ramosa) Maryna Kryvokhyzha1. In 25th Conference of the Austrian Society of Plant Biology : book of Abstracts, 29th to 31st of May 2025, Tulln an der Donau. - 2025, p. 80. Dostupné na internete: https://boku.ac.at/fileadmin/data/H03000/H83000/H83100/files/ATSPB/ATSPB_2025_BoA.pdf (09I03-03-V01-00142 : Maryna Kryvokhyzha, R2 - Postdoktorand.) Typ: GII
• KRYVOKHYZHA, M. - DANCHENKO, Maksym - KLUBICOVÁ, Katarína - KOVÁČ, Andrej - BEKE, Gábor - MATÚŠOVÁ, Radoslava. C0267 Proteomic and gene expression insights into early germination of Phelipanche induced by strigolactone analog GR24. In Iberian Plant Biology - 2025 : abstract book, Murcia, Spain, July 1–4, 2025. - Murcia, 2025, p. 178. Dostupné na internete: <www.iberianplantbiology2025.org> (09I03-03-V01-00142 : Maryna Kryvokhyzha, R2 - Postdoktorand.) Typ: GII
• KUSÁ, Zuzana - ŠAFRÁNEK, Martin - PETERKOVÁ, Darina - LABAJOVÁ, Mária - SHUMBUSHO, Alain - KRAUSKO, Miroslav - SINGH SHEKHAWAT, Gyan - DANCHENKO, Maksym - BARÁTH, Peter - JÁSIK, Ján**. Alterations in the proteomic profiles of Arabidopsis roots triggered by sodium chloride stress are exacerbated by impaired function of SYNAPTOTAGMIN 1. In BMC Plant Biology, 2025, vol. 25, art. no. 1640. (2024: 4.8 - IF, Q1 - JCR, 1.134 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 1471-2229. Dostupné na: https://doi.org/10.1186/s12870-025-07665-6 (APVV-23-0463 : Molekulárna analýza saynaptotagmínov a ich úlohy vo vývine suchozemských rastlín (Molecular dissectiíon of synaptotagmins and their roles in the development of land plants).) Typ: ADCA
• KUSÁ, Zuzana** - ŠAFRÁNEK, Martin - PETERKOVÁ, Darina - LABAJOVÁ, Mária - SHUMBUSHO, Alain - KRAUSKO, Miroslav - SINGH SHEKHAWAT, Gyan - DANCHENKO, Maksym - BARÁTH, Peter - JÁSIK, Ján. Alterations in the proteomic profiles of Arabidopsis roots triggered by sodium chloride stress are exacerbated by impaired functional of SYNAPTOTAGMIN 1. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 116. ISSN 1213-6670. (APVV-23-0463 : Molekulárna analýza saynaptotagmínov a ich úlohy vo vývine suchozemských rastlín (Molecular dissectiíon of synaptotagmins and their roles in the development of land plants).) Typ: AFL
• KUSÁ, Zuzana - ŠAFRÁNEK, Martin - PETERKOVÁ, Darina - LABAJOVÁ, Mária - SINGH SHEKHAWAT, Gyan - DANCHENKO, Maksym - BARÁTH, Peter - JÁSIK, Ján. Changes in the Arabidopsis root proteome due to salt stress and altered SYNAPTOTAGMIN 1 function. In International Conference on Arabidopsis Research 2025 and Vascular Development 2025 : 14-20th June’ 2025. - Ghent, 2025, p. 420. Dostupné na internete: http://www.icar2025.com/ (APVV-16-0398 : Molekulárna analýza saynaptotagmínov a ich úlohy vo vývine suchozemských rastlín (Molecular dissectiíon of synaptotagmins and their roles in the development of land plants). APVV-23-0463 : Molekulárna analýza saynaptotagmínov a ich úlohy vo vývine suchozemských rastlín (Molecular dissectiíon of synaptotagmins and their roles in the development of land plants).) Typ: GII
• LAKHNEKO, Olha - STASIK, Oleg - KIRIZIY, Dmytro - SOKOLOVSKA-SERGIIENKO, Oksana - DANCHENKO, Maksym. Adaptive proteome underpins tolerance in bread wheat during flowering. In Thirteenth Annual Conference of the Czech Society for Mass Spectrometry and Eleventh Informal Proteomic Meeting (joint meeting) : book of Abstracts, České Budějovice, 19 – 21, november 2025, p. 55. Dostupné na internete: <www.czechms.org> (VV-MVP-24-0368 : Regulácia odolnosti pšenice voči suchu na úrovni redox proteómu.) Typ: AFG
• LAKHNEKO, Olha - UMAR, Mohammad - STASIK, Oleg - KOHÚTOVÁ, Lenka - DANCHENKO, Maksym. Deciphering adaptive shifts in the redox proteome of wheat seedlings under drought. In Thirteenth Annual Conference of the Czech Society for Mass Spectrometry and Eleventh Informal Proteomic Meeting (joint meeting) : book of Abstracts, České Budějovice, 19 – 21, november 2025. - Česká společnost pro hmotnostní spektrometrii Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého, 2025, p. 33. ISBN 978-80-907478-5-2. Dostupné na internete: <www.czechms.org> (VEGA 2/0106/22 : Chronické ionizujúce žiarenie ovplyvňuje odolnosť divorastúcich vodných rastlín proti škodcom: Objav a potvrdenie biochemických mechanizmov.) Typ: AFG
• LAKHNEKO, Olha - STASIK, Oleg - KIRIZIY, Dmytro - SOKOLOVSKA-SERGIIENKO, Oksana - DANCHENKO, Maksym. Adaptive proteomic shifts in bread wheat suggest mechanisms of drought tolerance during flowering. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 120-121. ISSN 1213-6670. Typ: AFH
• LAKHNEKO, Olha - STASIK, Oleg - KIRIZIY, Dmytro - SOKOLOVSKA-SERGIIENKO, Oksana - KOVALENKO, Mariia - DANCHENKO, Maksym. Proteomic responses to transient drought in bread wheat: Unveiling mechanisms of tolerance. In 2nd RECROP Annual Meeting "Climate-Proof Crop Reproduction: from lab to farm" : book of abstracts, Thessaloniki, 13-15 May 2025. - 2025, p. 40. (09I03-03-V01-00005 : Olha Lakhneko, R2 – Postdoktorand.) Typ: GII
• MISHRA, Shubhi - GUDKOV, Dmitri - LAKHNEKO, Olha - BARÁTH, Peter - ŠPANIEL, Stanislav - DANCHENKO, Maksym**. Chronic ionizing radiation might suppress resistance to pathogens in aquatic plants without substantial oxidative stress. In Science of the Total Environment, 2025, vol. 982, art. no. 179614. (2024: 8 - IF, Q1 - JCR, 2.137 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 0048-9697. Dostupné na: https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2025.179614 (VEGA č. 2/0106/22 : Chronické ionizujúce žiarenie ovplyvňuje odolnosť divorastúcich vodných rastlín proti škodcom: Objav a potvrdenie biochemických mechanizmov (Chronic ionizing radiation affects susceptibility to pests in wild aquatic plants: Discovery and validation of biochemical mechanisms). APVV-20-0545 : Chronické ionizujúce žiarenie narúša odolnosť vodných rastlín voči škodcom: Štúdium a validácia biochemických mechanizmov (Chronic ionizing radiation compromises resistance to pests in wild aquatic plants: Discovery and validation of biochemical mechanisms).) Typ: ADCA
• MISHRA, Shubhi - GUDKOV, Dmitri - LAKHNEKO, Olha - BARÁTH, Peter - ŠPANIEL, Stanislav - DANCHENKO, Maksym. Chronic ionizing radiation impact on pathogen resistance in aquatic plants. In Plant Biology Europe 2025. - Budapest, Madarsko : PBE, 2025, p. 3. ISBN 978-615-6833-02-0. Dostupné na internete: https://pbe2025-budapest.org/. (APVV 20 0545 : AQUARAD - Chronické ionizujúce žiarenie narúša odolnosť vodných rastlín voči škodcom: štúdium a validácia biochemických mechanizmov. APVV-0250-10 : Predikcia epidémie/pandémie chrípky typu A na základe identifikácie dominantných markerov patogenity a prenosnosti vírusu.) Typ: AFG
• MISHRA, Shubhi - GUDKOV, Dmitri - LAKHNEKO, Olha - BARÁTH, Peter - ŠPANIEL, Stanislav - DANCHENKO, Maksym. Aquatic plants in Chornobyl are susceptible to pathogens. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 69. ISSN 1213-6670. (VEGA 2/0106/22 : Chronické ionizujúce žiarenie ovplyvňuje odolnosť divorastúcich vodných rastlín proti škodcom: Objav a potvrdenie biochemických mechanizmov.) Typ: AFH
• MISHRA, Shubhi - NAUTS, Robin - HOREMANS, Nele - GUDKOV, Dmitri - DANCHENKO, Maksym. Do aquatic plants from Chornobyl zone retain the chronic ionizing radiation stress - induced memory? In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 127. ISSN 1213-6670. (APVV 20 0545 : AQUARAD - Chronické ionizujúce žiarenie narúša odolnosť vodných rastlín voči škodcom: štúdium a validácia biochemických mechanizmov. VEGA 2/0106/22 : Chronické ionizujúce žiarenie ovplyvňuje odolnosť divorastúcich vodných rastlín proti škodcom: Objav a potvrdenie biochemických mechanizmov.) Typ: AFH
• NOVÁKOVÁ, Slavomíra - HATOKOVÁ, Zuzana - DANCHENKO, Maksym** - BEKE, Gábor - KĽUČÁR, Ľuboš - SLOVINSKÁ, Lucia - HARVANOVÁ, Denisa - BARÁTH, Peter - STRNÁDEL, Ján - HALAŠOVÁ, E. - ŠKOVIEROVÁ, Henrieta. Proteomic Study Revealed a Distinction Between Human Dermal Fibroblasts and Mesenchymal Stem Cells from Different Sources. In Stem Cell Reviews and Reports, 2025, vol. 21, no. 7, p. 22237-2252. (2024: 4.2 - IF, Q2 - JCR, 1.219 - SJR, Q2 - SJR). ISSN 2629-3269. Dostupné na: https://doi.org/10.1007/s12015-025-10926-4 Typ: ADMA
• PAPRČKOVÁ, Adriana* - KLUBICOVÁ, Katarína* - ÜRGEOVÁ, Eva - DANCHENKO, Maksym - BARÁTH, Peter - LAKHNEKO, Olha - KRAJČOVIČ, Juraj - UVÁČKOVÁ, Ľubica**. Peculiar proteome of dark-cultivated Euglena gracilis. In Scientific Reports, 2025, vol. 15, no. 1, art. no. 25721. (2024: 3.9 - IF, Q1 - JCR, 0.874 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 2045-2322. Dostupné na: https://doi.org/10.1038/s41598-025-11308-z Typ: ADCA
• UMAR, Mohammad - LAKHNEKO, Olha - KALE, Rohan Arjun - BARÁTH, Peter - DANCHENKO, Maksym. Effect of drought on the wheat grain proteome of bread wheat. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2025 : zborník recenzovaných príspevkov. Mária Chovancová, Táňa Sebechlebská, Dominik Kostoláni, Dominik Juračka, Dominik Šmida (eds.). 1. vyd. - Bratislava : Univerzita Komenského, 2025, p. 635 - 639. ISBN 978-80-223-6080-7. (09I03-03-V01-00005 : Olha Lakhneko, R2 – Postdoktorand.) Typ: AFD
• UMAR, Mohammad - LAKHNEKO, Olha - STASIK, Oleg - DANCHENKO, Maksym. Aftermath of transient drought on grain proteome of wheat. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 29. ISSN 1213-6670. Typ: AFH
• UMAR, Mohammad - LAKHNEKO, Olha - STASIK, Oleg - DANCHENKO, Maksym. Aftermath of transient drought on grain proteome of wheat. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti : Bulletin 2025. Book of Abstracts. 18th Students Days in Plant Biology CS 2025. August 24 - 25, 2025 Bratislava, Slovakia, 2025, roč. 2025, č. 1, s. 148. ISSN 1213-6670. Typ: AFL