Zameranie
Venujeme sa diverzite, ekologickým interakciám a trofickým preferenciám rastlín a mikroorganizmov, predovšetkým húb. Študujeme evolučné adaptácie, ekologické niky, enzymatické a metabolické aktivity a ďalšie biologické charakteristiky druhov. Aplikujeme pohľad na spoločenstvá organizmov z pohľadu jediného druhu s ktorým interagujú. Využívame profily húb a rastlín na rozlíšenie fungovania ekosystému. Zaujíma nás zmena diverzity a funkcie ekosystémov pri zmene definovaných environmentálnych podmienok. Náš výskum dávame do kontextu s kľúčovými spoločenskými témami týkajúcimi sa úbytku biodiverzity, klimatickej zmeny a udržateľného poľnohospodárstva. Objekty nášho výskumu zahŕňajú pôdne mikrobiálne ekosystémy, lichenizované synúzie a rastlinné pletivá (listy, semená, korene). Venujeme sa aj evolučnej histórii, diverzifikácií, speciačným mechanizmom a biogeografii zelených rastlín (Viridiplantae), lichenizovaných a nelichenizovaných húb.
Metódy
- extrahovanie DNA z pletív študovaných organizmov
- sekvenovanie novej generácie: RAD-Seq, Hyb-Seq
- analýza spoločenstiev mikroorganizmov pomocou amplikónového sekvenovania
- sekvenovanie DNA metódou Sanger
- bioinformatické spracovanie molekulárnych dát
- karyologické analýzy (prietoková cytometria, priame počítanie chromozómov)
- štúdium reprodukčných stratégií rastlín (životaschopnosť peľu, produkcia plodov, klíčenie semien, klonalita)
- rekonštrukcia morfologických a ekologických adaptácií organizmov
Vízia
Rozlúštenie života na hraniciach možností – vplyv environmentálnych extrémov
Špecifické otázky
Ako druhy žijúce na skalách prenikajú náročným skalnatým prostredím, aby maximalizovali svoju zdatnosť a dlhodobé prežitie?
Ktoré adaptácie a/alebo symbiotické vzťahy im umožňujú pretrvať v nehostinných biotopoch?