Venujeme sa komplexným interakciám rastlín a mikroorganizmov, predovšetkým húb. Študujeme diverzitu, ekologické niky a trofické preferencie rastlinných druhov a húb, skúmame ich evolučné adaptácie, enzýmové a metabolické aktivity a ďalšie biologické vlastnosti. Náš prístup je zameraný na pochopenie toho, ako jednotlivé druhy interagujú v ekosystémoch, pričom využívame profily húb a rastlín na hodnotenie funkčnosti ekosystémov. Zvlášť nás zaujíma, ako sa tieto interakcie menia v závislosti od zmeny environmentálnych podmienok a ako sú tieto procesy spojené so širšími globálnymi problémami, ako je úbytok biodiverzity, klimatická zmena a udržateľné poľnohospodárstvo. Spojením molekulárnej ekológie, systematiky a ekologickej teórie sa usilujeme lepšie pochopiť ekologické úlohy hubových druhov a ich reakcie na ekologické stresory, čím poskytujeme cenné poznatky o dynamike ekosystémov a podporujeme stratégie ochrany prírody a riadenia krajiny.
Kladieme silný dôraz na kariérny rozvoj mladých vedeckých pracovníkov ich zapojením do hlavných projektových výziev oddelenia a podporou ich medzinárodných študijných, výskumných a post-doc pobytov.
Pracovníci oddelenia OMRI spravujú a aktívne budujú zbierku húb, vrátane lišajníkov, ktorá je súčasťou herbára a zbierok CBRB SAV, v. v. i. s akronymom SAV.
Laboratórium molekulárnej ekológie a mykológie (MEM)
Zaoberáme sa funkčnou diverzitou a interakciou húb s ďalšími komponentmi prostredia, pričom základnou požiadavkou pre pochopenie procesov v biologických ekosystémoch je znalosť evolúcie a fylogenézy druhov a ich adaptácie. Preto sa dlhodobo venujeme aj výskumu taxonómie a fylogenézy húb. Tieto poznatky prepájame s bioklimatickými údajmi pre pochopenie prepojenia fylogenézy húb s ich rozšírením. Okrem toho je dôležité poznať ekologické požiadavky najmä patogénnych a mykoríznych druhov húb. Taxonomické znalosti sú takisto používame v metabarkódingových štúdiách hubových spoločenstiev pričom využívame environmentálnu DNA. Funkčné skupiny jednotlivých druhov využívame na sledovanie reakcií hubových spoločenstiev na rôzne ekologické faktory. Kombinujeme metódy pokročilej svetelnej mikroskopie, DNA extrakcií zo stielok jednotlivých húb aj z environmentálnych vzoriek, fylogenetické analýzy, bioinformatické analýzy metabarcodingových matíc, kultivácie čistých kultúr húb a sledovanie mikrobiálnych enzymatických aktivít.
Laboratórium evolučných mechanizmov a environmentálnych interakcií (EMEI)
Skúmame zelené rastliny a huby, najmä lichenizované, v širšom evolučnom kontexte. Zaoberáme sa evolučnými procesmi, ktoré formujú diverzitu týchto organizmov a ich populácií, pričom sa zameriavame najmä na to, ako sa prispôsobili rôznym environmentálnym podmienkam v čase a priestore. Pomocou molekulárnych nástrojov skúmame genetické a ekologické faktory ovplyvňujúce vznik a rozšírenie druhov. Naša výskumná činnosť kladie dôraz na pochopenie zložitých interakcií medzi environmentálnymi faktormi a evolučnými procesmi, ktoré ovplyvňujú adaptáciu rastlín a húb. Štúdiom genetických základov speciácie a ekologickej adaptácie sa snažíme odhaliť evolučné vzorce, ktoré sa odlišujú od tých pozorovaných u cievnatých rastlín, a tak prispieť k hlbšiemu porozumeniu biodiverzity a dynamiky ekosystémov.