- Evolúcia a speciácia (EaS)
- Genetické zdroje pre biotechnológie (CarniTech)
- Laboratórium biodiverzitnej informatiky a Flóry Slovenska (BiodInf)
- Laboratórium evolučných mechanizmov (EMEI)
- Laboratórium molekulárnej ekológie a mykológie (MEM)
- Nepôvodné a invázne organizmy (NIO)
- Plant Stress
- Transdisciplinárny výskum (TRA)
